有限公司转让股权收入应当缴纳个人所得税。转让股权收入属于财产转让所得，适用比例税率，税率为百分之二十。以股权转让收入减除取得股权所支付的金额和转让过程中所支付的相关合理费用后的余额，为应纳税所得额。
【法律依据】
《中华人民共和国个人所得税法》第三条
个人所得税的税率：
（一）综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率（税率表附后）；
（二）经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率（税率表附后）；
（三）利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。