法律分析：公积金贷款首套房和二套房的区别是：
一、首付款比例不同：公积金贷款首套房住房公积金贷款首付款比例不低于20%；二套房住房公积金贷款首付款比例不低于30%。
二、利率不同：公积金贷款首套房贷款利率为住房公积金贷款基准利率；二套房贷款利率上浮至住房公积金贷款基准利率的1.1倍。
法律依据：《中华人民共和国住房公积金管理条例》
第三条 职工个人缴存的住房公积金和职工所在单位为职工缴存的住房公积金，属于职工个人所有。
第四条 住房公积金的管理实行住房公积金管理委员会决策、住房公积金管理中心运作、银行专户存储、财政监督的原则。
第五条 住房公积金应当用于职工购买、建造、翻建、大修自住住房，任何单位和个人不得挪作他用。
第六条 住房公积金的存、贷利率由中国人民银行提出，经征求建设行政主管部门的意见后，报批准。